生物质谱是蛋白质组研究最重要的研究仪器,大部分蛋白质组的研究都难免会牵涉到生物质谱数据的解析。然而,由于蛋白质组的复杂性,当前已有的软件平台没法满足相应的数据处理和质量控制的需要。针对上述问题,生物信息学组在生物质谱鉴定结果的质量控制、定量方法的开发、修饰结果的鉴定等方面做了大量的工作,开发了自己的数据分析、处理和质量控制平台。随着生物质谱仪器的发展,我们的质谱数据计算方法也在进一步地发展......
为了满足蛋白质组数据存储、展现和重复利用的需求,生物信息学组先后开发了多个肝脏蛋白质组相关的数据库。当前已经开发了肝脏相关的多个数据库,包括:蛋白质肝脏表达谱数据库:dbLEP
蛋白质肝脏相互作用数据库:dbLIP
蛋白质肝脏蛋白质修饰数据库:dbLMP
蛋白质肝脏亚细胞定位数据库:dbLOC
蛋白质肝脏表达和功能数据库:Liverbase
蛋白质肝脏知识总库:LiverAtlas
蛋白质相互作用本体数据库:PPI ontology进一步的研究将在现有数据库基础上,根据生物学研究的需要开发蛋白质组相关的二级数据库,以推动中国蛋白质组的研究。