北京蛋白质组研究中心生物信息学研究室/技术平台位于环境优美的中关村生命科学园内，是蛋白质组学国家重点实验室及国际人类肝脏蛋白质组计划（HLPP）表达谱和修饰谱项目的实施平台之一，相继在蛋白质组学方面承担了一系列国家973、863、自然科学基金及北京市重大项目等课题。

研究组与众多家实验室开展合作研究，包括重点实验室内其他实验室、院所其他实验室及国内外其他实验室（曾在中心接受外来团队的合作研究，包括国防科大六院、加拿大McGill大学John Bergeron教授等）。也与国际著名蛋白质组数据库进行合作和数据提交，包括EBI的Pride数据库、美国ISB的PeptideAtlas、John Hopkins University的Human ProteinPedia数据库以及NIST等。